口袋妖怪火红中共有8个道馆，分别位于尼比市、华蓝市、枯叶市、彩虹市、黄金市、浅红市、红莲岛和常磐市。每个道馆对应不同的属性类型，挑战顺序基本遵循游戏主线推进路径。道馆位置与城市功能紧密关联，通常位于城市中心或显要位置，玩家需通过击败馆主获得徽章以解锁后续剧情和技能使用权限。
尼比市岩石道馆是玩家遇到的第一个道馆，馆主小刚使用LV12小拳石和LV14大岩蛇。从真新镇向北经1号道路和常磐森林可达，道馆采用灰色岩石建筑外观。华蓝市水道馆位于城市东北部，馆主小霞拥有LV18海星星和LV21宝石海星，需从尼比市向东穿越月见山后抵达。枯叶市电系道馆需要先获得居合斩技能清除门口树木，馆主马志士使用LV21雷电球、LV18皮卡丘和LV24雷丘，内部设有垃圾桶机关谜题。
彩虹市草系道馆需先完成火箭队基地任务，馆主艾莉嘉使用LV29大食花、LV24长藤怪和LV29霸王花。黄金市超能道馆涉及警卫通行剧情，需从紫苑镇经地下通道获取热茶交给守卫，馆主娜姿以高精神力攻击著称。浅红市毒系道馆位于狩猎区附近，红莲岛火系道馆需通过双子岛水路抵达，常磐市地面系道馆作为最终道馆仅在二周目开放，馆主为火箭队首领坂木。
道馆挑战需注意属性克制关系，岩石道馆推荐使用水系或草系宝可梦，水道馆建议配备电系技能，电系道馆适合地面系宝可梦应对。每个道馆胜利后除获得徽章外，还能得到对应技能机器，如岩石封、水之波动、电磁波等。部分道馆设有特殊机关，如枯叶市道馆的垃圾桶开关、彩虹市道馆的隐形墙等，需观察环境规律破解。
后期道馆挑战难度显著提升，建议队伍平均等级达到馆主宝可梦1.2倍以上。红莲岛道馆需先解决岛屿任务，常磐道馆要求集齐前7枚徽章。游戏存在道馆挑战顺序调整机制，但推荐按尼比、华蓝、枯叶、彩虹、黄金、浅红、红莲的路线推进，以确保技能获取与剧情发展同步。二周目新增的常磐道馆将检验玩家整体队伍强度。
道馆位置设计体现游戏区域联通逻辑，东部沿海分布枯叶、浅红道馆，中部串联彩虹、黄金道馆，岛屿区域设置红莲道馆。通过道馆挑战可逐步解锁冲浪、怪力等秘传技能，这些技能又能帮助玩家到达新区域。建议在挑战前保存进度，针对不同馆主调整队伍配置，合理利用道具和技能组合提高胜率。完成全部道馆挑战后，玩家将获得进入宝可梦联盟的资格。
