火影忍者手游中克制药师兜的核心策略在于针对其技能机制进行反制，需从远程压制、仙术打断、幻术破解以及查克拉消耗四方面入手。药师兜的核心优势在于仙人模式下的高爆发仙术和范围幻术控制，但其近战能力相对薄弱，且依赖查克拉维持状态转换。实战中需优先破坏其节奏，利用特定忍者的技能组合或秘卷效果实现压制。
药师兜的遁地技能可规避大部分直线攻击，但Y轴移动能力有限，建议使用大范围AOE技能覆盖战场。例如风遁·真空波或水遁·水龙弹等秘卷能有效限制其走位，同时注意其蛇系替身术的冷却时间约为15秒，抓住真空期进行连招是关键。当药师兜开启仙人模式时，必须及时使用抓取类技能打断其仙法·白激之术的吟唱，否则后续的高频振动伤害将难以应对。
针对秽土转生召唤单位，需优先解决具备治疗能力的忍者，如千手柱间或漩涡玖辛奈。若敌方为意志型秽土角色（如宇智波鼬），可通过持续攻击触发其自主解除状态。药师兜的幻术·涅槃精舍之术需保持至少20米距离规避，携带解术复秘卷可快速脱离控制。其奥义喜蛇临门具备全屏睡眠效果，但释放前有1.5秒结印动作，可用瞬发奥义抢攻打断。
查克拉管理是决胜要点，药师兜在连续使用两次仙术后会进入10秒虚弱期。建议保留至少2格查克拉用于反制，通灵兽选择猿魔或山椒鱼可破坏其节奏。当敌方查克拉低于30%时，药师兜无法维持液态化防御，雷属性攻击能造成额外伤害。战场中需时刻观察其资料板记录的治疗方案，预判下一轮技能组合。
